Après une enfance en Norvège, Hélène Bouchez est initiée à la musique par deux pédagogues américains, Curtis Stotlar et Perry Johnson. Sa vocation musicale se réalise à travers la direction d'orchestre, le piano et la musique de chambre.
En France, elle est invitée aux Folles journées de Nantes, à l'orchestre national d'Ile-de-France, l'orchestre Poitou-Charentes, l'opéra de Rouen, l'orchestre symphonique de Vichy, l'orchestre de Picardie, l'atelier XXI° de Lyon, l'ensemble Sillages, l'orchestre philharmonique de Nice avec l'ensemble Apostrophe, et l'orchestre philharmonique de Radio-France (en répétitions). Elle sera prochainement directeur musical pour la création du Verfügbar aux enfers de Germaine tillion dans la saison du théâtre du Châtelet à Paris.
Investie dans tous les répertoires, du baroque à la musique d'aujourd'hui, Hélène Bouchez dirige de nombreuses créations. Elle collabore avec des compositeurs français comme Philippe Leroux, François Paris, Thierry Blondeau. Elle dirige au festival Manca de Nice, au festival  Aujourd'hui musiques  de Perpignan.
Aux Etats-Unis, Hélène Bouchez dirige le national symphony orchestra (Washington). Lauréate du concours du Boston symphony orchestra, elle y est invitée en résidence pendant deux mois et effectue de nombreux concerts à Tanglewood. Aux U.S.A, elle travaille également auprès de Leonard Slatkin, Marin Alsop (festival of Contemporary music en Californie), Kurt Masur, Seiji Ozawa, Raphaël Frübeck de Burgos…
En Asie, elle est finaliste lauréate du concours international de direction d'orchestre de Tokyo (2003). Elle dirige le new japan philharmonic et reçoit une dotation du « Min-On association concert ».
En Europe, Hélène Bouchez travaille auprès de Pierre Boulez au festival de Lucerne et dirige ses Notations . Elle se produit en concert avec l'orchestre philharmonique de Sarajevo, l'orchestre symphonique de Szombathely (Bartok festival/Hongrie), l'orchestre symphonique de Sofia (Sienne, Italie).
En France, elle dirige l'orchestre national de Lyon (Messiaen « Turangalîla-symphonie » avec David Robertson). Elle est auparavant responsable de l'orchestre de l'université Claude Bernard à Lyon et l'orchestre symphonique de Lyon.
Hélène Bouchez étudie la direction d'orchestre au conservatoire national supérieur de musique de Paris (prix mention très bien à l'unanimité) et y a également reçu le « prix Marcel Dautremer ». Elle étudie le piano au conservatoire national supérieur de musique de Lyon (prix mention très bien à l'unanimité) avec Eric Heidsieck et Roger Muraro. Elle y est actuellement professeur-assistante depuis 2001 (classe de piano de Géry Moutier).
Hélène Bouchez a reçu une formation littéraire hypokhâgne et khâgne. Elle est titulaire du certificat d'aptitude et titulaire d'une Maîtrise de musicologie.